精选丨肽谱分析用蛋白酶

 

 

质谱法肽段覆盖率/肽谱图全序列测定的流程：

• 使用蛋白酶（PNGase F、Trypsin、Chymotrypsin、Asp-N、Glu-C、Lys-C、Lys-N）等分别对靶蛋白进行酶切和鉴定

• 用nano LC-MS/MS或者UV LC-MS/MS对样品进行分析

• 得到的肽段覆盖率/肽谱图全序列与您提供的理论序列进行比对

• 比对结果

 

数据分享：

重组胰蛋白酶Trypsin（质谱级）：

 

BSA样品经Trypsin酶解及LC-MS/MS分析后序列覆盖率为99.7%。

 

重组赖氨酰内切酶(Lys-C)：

 

与进口品牌Lys-C比较，肽图图谱基本一致，且常见PTM基本无差异。

 

V8 蛋白酶（Glu-C）：

 

BSA样品经Glu-C酶解及LC-MS/MS分析后序列覆盖率为98.3%

 

重组α-糜蛋白酶(α-Chymotrypsin):

 

与主流品牌糜蛋白酶比较蛋白酶切后，肽图图谱、序列覆盖度基本一致

 

金属蛋白酶（Asp-N）：

 

BSA样品经AspN-1酶解及LC-MS/MS分析后序列覆盖率为91.8%

 

糖苷酶PNGase F(Glycerol-free):