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小知识
PROTAC(Proteolysis targeting chimeras,蛋白靶向水解嵌合体)是一种双功能分子,由三个部分组成:靶蛋白结合配体、E3泛素连接酶配体、连接链。在细胞中PROTAC分子能够识别并选择性地结合靶蛋白,招募特定的E3泛素连接酶,形成“靶蛋白-PROTAC-E3泛素连接酶”三元复合物。之后E3泛素连接酶与E2泛素结合酶共同作用,对靶蛋白进行泛素化,由于泛素-蛋白酶体系统是人体内蛋白降解的重要途径,参与细胞内80%以上蛋白质的降解,故靶蛋白被泛素化标记后,PROTAC分子与靶蛋白、E3泛素连接酶分离,泛素标记的靶蛋白就会被蛋白酶体识别并降解。
图1:PROTAC功能示意图
XIAP结构
IAP(Inhibitor of Apoptosis Protein,凋亡抑制蛋白)是一类在结构上具有同源性的细胞内源性凋亡抑制蛋白家族,在进化上高度保守,广泛存在于各种动物的细胞中。人类中发现了8种IAP分别为:NAIP(BIRC1)、BIRC2(Ciap1)、BIRC3(cIAP2)、XIAP(BIRC4)、BIRC5(survivin)、BIRC6(apollon)、BIRC7(Livin)、BIRC8。与其他IAPs家族蛋白相同,XIAP可通过阻断凋亡通路抑制细胞凋亡。然而XIAP在结构和序列上不是特别保守,因此也称为类人IAP蛋白(h IAP like protein)。
XIAP (X-linked inhibitor of apoptosis protein, X-染色体连锁抑制凋亡蛋白)基因位于Xq24-25,编码区位于129bp-1622bp之间,由7个外显子组成,转录区长9.0Kb,编码区含497个氨基酸,相对分子质量为57kDa的蛋白质。XIAP由多个特征性的结构域组成:1.N-末端包含3个杆状病毒的IAP重复结构域(baculovirus IAP repeats,BIR):BIR1、BIR2、BIR3。BIR结构域包含3个反向平行的β折叠和4个α螺旋。BIR结构域直接抑制Caspase-3/-7/-9功能。2:C末端由1个环状指结构(RNG)组成,有E3泛素连接酶活性,能催化自身及靶蛋白通过泛素化降解,同时改变修饰蛋白的活性。3.泛素相关结构域UBA,直接结合多泛素(polyUb)链,从而参与泛素依赖的信号通路。
图2:XIAP蛋白结构示意图
NMR结果表明,在BIR1和BIR2之间有段连接子,是XIAP与Caspase-7相互作用的唯一位点。
XIAP的功能
细胞凋亡、自噬、坏死
细胞凋亡是调控细胞死亡的高度控制的过程,从胚胎发育到死亡一直处于激活的状态。XIAP能够阻断Caspase-3/-7/-9的激活和成熟,从而阻断细胞凋亡。Caspase(半光氨酸天冬氨酸特异性蛋白酶)家族,也称为ICE/CED-3家族,其凋亡启动子在级联反应的上游。
图3:XIAP在凋亡中的作用
线粒体途径的是细胞凋亡的内源性途径。当受到细胞凋亡信号刺激时,线粒体可释放细胞色素C和Smac/DIABLO(线粒体膜间隙蛋白),细胞色素C能与细胞内存在的一种凋亡蛋白酶激活因子(Apoptosis Protease Activating Factor-1,Apaf-1)结合,在dATP存下条件下,Apaf-1和Caspase-9酶原结合,使Caspase-9酶原活化,然后激活下游的效应半胱氨酸蛋白酶如Caspase-3、6、7、8、10,从而启动细胞凋亡。XIAP可以抑制细胞色素C的释放,使得Caspase途径的激活受到抑制。同样,Smac/DIABLO释放进入细胞质后,能与XIAP结合,抑制XIAP结合Caspase的能力,促进细胞凋亡。
在肿瘤细胞中,XIAP可能会通过与TRAFs结合,使活化核因子NF-κB由细胞质转入细胞核内,激活靶基因,导致XIAP的表达增加,抑制Caspase。XIAP和UBA突变实验表明,BIR1和UBA与NF-κB的激活有关。
XIAP也参与细胞的坏死和自噬。研究表明,XIAP可以抑制自噬,通过介导Mdm2-p53信号通路促进肿瘤的生成。
免疫过程
XIAP也可通过NOD2((Nucleotide-binding Oligomerization Domain-containing protein 2)信号通路调控免疫过程。NOD2也被称为NLRC2,属于NLR家族,是革兰阳性和革兰阴性菌的肽聚糖衍生的细胞内模式识别受体。NOD2的激活后诱导XIAP介导的RIPK2多泛素化,RIPK2泛素化后募集LUBAC,LUBAC反过来线性化泛素化RIPK2,增加IKK亚基的募集。激活NF-κB和MAPK依赖的细胞因子的转录比如TNF(扩大炎症信号)。
Dectin-1是一个跨膜的模式识别受体,可以识别β-葡聚糖。Dectin-1激活后,XIAP可以结合并泛素化BCL-10,BCL-10激活NF-κB和MAPK通路并促进细胞因子表达。
图4:XIAP在免疫过程中的作用
XIAP过表达与多种肿瘤相关,过表达的XIAP抑制细胞凋亡,促进肿瘤的发生,同时也导致肿瘤对多种药物耐药性增加。
目前针对XIAP的治疗研究包括小分子抑制剂研究、反义寡核苷酸技术(ASODN)、RNA干扰技术(RNAi)、PROTAC技术等。
后面我们将详细给大家介绍PROTAC技术,敬请期待~
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1.Evolulution of Our Understanding of XIAP Deficiency.
2.XIAP's Profile in Human Cancer.
3.蛋白水解靶向嵌合体(PROTAC)连接链优化的研究进展.